1897 г. - родилась в Санкт-Петербурге. Прадед - саксонский стеклодув, поселившийся в Санкт-Петербурге. Отец - агроном (по другим сведениям - садовник, ботаник) немецкого происхождения. Братья - Борис (1893-1960) и Юрий (1898–1963). Сестра - Ксения (1895–1955).
Ок.1914 г. - окончила Константиновскую гимназию.
С 1915 по 1918 гг. – обучение в Петроградском Педагогическом институте (словесное отделение).
Ок.1915 г. – знакомство и кратковременное обучение у К.Малевича.
1916 г. - знакомство с художником М.Матюшиным. Занятия с ним живописью, рисованием и музыкой. До конца жизни художника оставалась его ближайшим помощником, именно ей Матюшин диктовал свою автомонографию, написанную им незадолго до смерти.
1918 - 1922 гг. обучение в Петроградских государственных свободных мастерских (бывшей Академии художеств) у М. Матюшина (мастерская пространственного реализма.).
С 1922 г. - участница выставок.
1923-1926 гг. - научный сотрудник Отдела Органической культуры в Государственном институте Художественной Культуры
- Заведование отделением использования периферического восприятия цветоформы. Руководитель Лаборатории цвета и формы изобразительного искусства (ГИНХУК, ГИИИ, Русский музей).
- Работа в лаборатории «зрения, слуха, осязания» по исследованию цветоформы в пространстве.
- Самостоятельная работа по исследованию цвета (интервал, тональность, обертон в цвете).
- Многочисленные доклады, подготовки научных статей.
1927-1928 гг. - подготовка работ «Цвет и цветовое сочетание», «О дополнительной форме», «Пространство и форма», «Культура статического и динамического цвета» и др.
В 1920-х-1930-е гг. - работа в Институте истории искусств консультантом по окраске зданий Ленинграда (вокзалов, Домов культуры и т.д.),
- Учреждение Лаборатории цвета научно-исследовательского кабинета современной архитектуры в Ленинградском институте гражданских инженеров.
- Работа в Институте мозга над проблемой восприятия цветоформы.
- Преподавание цветоведения в Государственном художественно-промышленном техникуме.
- Преподавание в Институте пролетарского изобразительного искусства (бывшая Академия художеств) на Живописном факультете по дисциплине цвета.
1932 г. - участие вместе с М.Матюшиным в подготовке и публикации Справочника по цвету (в том числе написание ей предисловия к справочнику).
1937 г. - участие в оформлении советского павильона на Всемирной выставке в Париже.
1939 г. - участие в оформлении советского павильона на Всемирной выставке в Нью-Йорке.
1940 г. - участие в решении цветового оформления павильонов на Всесоюзной сельскохозяйственной выставке.
1942 г. - скончалась в Ленинграде во время блокады, похоронена в братской могиле на Серафимовском кладбище.
2025 г. - Музей Органической Культуры выпустил первую монографию о Марии Эндер "Взгляд на солнце"
